Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5Y3

CAMSAP1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP1Q5T5Y3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CAMSAP1Q5T5Y3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
CAMSAP1Q5T5Y3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CAMSAP1Q5T5Y3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CAMSAP1Q5T5Y3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CAMSAP1Q5T5Y3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CAMSAP1Q5T5Y3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
CAMSAP1Q5T5Y3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CAMSAP1Q5T5Y3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
CAMSAP1Q5T5Y3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CAMSAP1Q5T5Y3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CAMSAP1Q5T5Y3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CAMSAP1Q5T5Y3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
CAMSAP1Q5T5Y3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CAMSAP1Q5T5Y3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CAMSAP1Q5T5Y3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CAMSAP1Q5T5Y3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CAMSAP1Q5T5Y3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
CAMSAP1Q5T5Y3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CAMSAP1Q5T5Y3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CAMSAP1Q5T5Y3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CAMSAP1Q5T5Y3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
CAMSAP1Q5T5Y3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CAMSAP1Q5T5Y3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CAMSAP1Q5T5Y3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CAMSAP1Q5T5Y3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CAMSAP1Q5T5Y3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CAMSAP1Q5T5Y3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CAMSAP1Q5T5Y3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CAMSAP1Q5T5Y3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CAMSAP1Q5T5Y3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
CAMSAP1Q5T5Y3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.42
CAMSAP1Q5T5Y3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CAMSAP1Q5T5Y3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CAMSAP1Q5T5Y3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CAMSAP1Q5T5Y3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CAMSAP1Q5T5Y3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CAMSAP1Q5T5Y3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CAMSAP1Q5T5Y3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CAMSAP1Q5T5Y3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CAMSAP1Q5T5Y3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CAMSAP1Q5T5Y3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CAMSAP1Q5T5Y3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
CAMSAP1Q5T5Y3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
CAMSAP1Q5T5Y3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CAMSAP1Q5T5Y3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CAMSAP1Q5T5Y3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CAMSAP1Q5T5Y3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
CAMSAP1Q5T5Y3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CAMSAP1Q5T5Y3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CAMSAP1Q5T5Y3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CAMSAP1Q5T5Y3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CAMSAP1Q5T5Y3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CAMSAP1Q5T5Y3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CAMSAP1Q5T5Y3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CAMSAP1Q5T5Y3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
CAMSAP1Q5T5Y3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CAMSAP1Q5T5Y3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CAMSAP1Q5T5Y3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CAMSAP1Q5T5Y3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CAMSAP1Q5T5Y3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CAMSAP1Q5T5Y3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CAMSAP1Q5T5Y3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CAMSAP1Q5T5Y3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CAMSAP1Q5T5Y3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CAMSAP1Q5T5Y3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CAMSAP1Q5T5Y3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CAMSAP1Q5T5Y3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CAMSAP1Q5T5Y3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CAMSAP1Q5T5Y3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CAMSAP1Q5T5Y3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CAMSAP1Q5T5Y3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CAMSAP1Q5T5Y3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CAMSAP1Q5T5Y3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CAMSAP1Q5T5Y3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CAMSAP1Q5T5Y3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CAMSAP1Q5T5Y3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CAMSAP1Q5T5Y3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
CAMSAP1Q5T5Y3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CAMSAP1Q5T5Y3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CAMSAP1Q5T5Y3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CAMSAP1Q5T5Y3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CAMSAP1Q5T5Y3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
CAMSAP1Q5T5Y3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CAMSAP1Q5T5Y3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CAMSAP1Q5T5Y3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CAMSAP1Q5T5Y3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CAMSAP1Q5T5Y3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CAMSAP1Q5T5Y3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CAMSAP1Q5T5Y3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CAMSAP1Q5T5Y3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CAMSAP1Q5T5Y3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CAMSAP1Q5T5Y3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CAMSAP1Q5T5Y3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CAMSAP1Q5T5Y3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CAMSAP1Q5T5Y3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CAMSAP1Q5T5Y3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
CAMSAP1Q5T5Y3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
CAMSAP1Q5T5Y3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
CAMSAP1Q5T5Y3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms