Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
COL5A1-AS1Q5SY13 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms