Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mks1Q5SW45 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mks1Q5SW45 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mks1Q5SW45 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mks1Q5SW45 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mks1Q5SW45 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mks1Q5SW45 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mks1Q5SW45 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mks1Q5SW45 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mks1Q5SW45 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mks1Q5SW45 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mks1Q5SW45 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mks1Q5SW45 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mks1Q5SW45 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mks1Q5SW45 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mks1Q5SW45 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mks1Q5SW45 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mks1Q5SW45 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mks1Q5SW45 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mks1Q5SW45 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mks1Q5SW45 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mks1Q5SW45 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mks1Q5SW45 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mks1Q5SW45 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mks1Q5SW45 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mks1Q5SW45 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mks1Q5SW45 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mks1Q5SW45 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mks1Q5SW45 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mks1Q5SW45 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mks1Q5SW45 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mks1Q5SW45 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mks1Q5SW45 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Mks1Q5SW45 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mks1Q5SW45 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mks1Q5SW45 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mks1Q5SW45 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mks1Q5SW45 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mks1Q5SW45 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mks1Q5SW45 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mks1Q5SW45 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mks1Q5SW45 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mks1Q5SW45 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mks1Q5SW45 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mks1Q5SW45 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mks1Q5SW45 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mks1Q5SW45 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Mks1Q5SW45 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mks1Q5SW45 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms