Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.1 ms