Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgap44Q5SSM3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgap44Q5SSM3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgap44Q5SSM3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgap44Q5SSM3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgap44Q5SSM3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgap44Q5SSM3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgap44Q5SSM3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgap44Q5SSM3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgap44Q5SSM3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgap44Q5SSM3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgap44Q5SSM3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgap44Q5SSM3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgap44Q5SSM3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgap44Q5SSM3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgap44Q5SSM3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgap44Q5SSM3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgap44Q5SSM3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgap44Q5SSM3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgap44Q5SSM3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgap44Q5SSM3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgap44Q5SSM3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgap44Q5SSM3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgap44Q5SSM3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgap44Q5SSM3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgap44Q5SSM3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgap44Q5SSM3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgap44Q5SSM3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgap44Q5SSM3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgap44Q5SSM3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgap44Q5SSM3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgap44Q5SSM3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgap44Q5SSM3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgap44Q5SSM3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgap44Q5SSM3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgap44Q5SSM3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgap44Q5SSM3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgap44Q5SSM3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgap44Q5SSM3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgap44Q5SSM3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgap44Q5SSM3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgap44Q5SSM3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgap44Q5SSM3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgap44Q5SSM3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgap44Q5SSM3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgap44Q5SSM3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgap44Q5SSM3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgap44Q5SSM3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgap44Q5SSM3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgap44Q5SSM3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgap44Q5SSM3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgap44Q5SSM3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgap44Q5SSM3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arhgap44Q5SSM3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arhgap44Q5SSM3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Arhgap44Q5SSM3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Arhgap44Q5SSM3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arhgap44Q5SSM3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arhgap44Q5SSM3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgap44Q5SSM3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgap44Q5SSM3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgap44Q5SSM3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgap44Q5SSM3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arhgap44Q5SSM3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arhgap44Q5SSM3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arhgap44Q5SSM3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arhgap44Q5SSM3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arhgap44Q5SSM3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arhgap44Q5SSM3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap44Q5SSM3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap44Q5SSM3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap44Q5SSM3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap44Q5SSM3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap44Q5SSM3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap44Q5SSM3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap44Q5SSM3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap44Q5SSM3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap44Q5SSM3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap44Q5SSM3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap44Q5SSM3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap44Q5SSM3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap44Q5SSM3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap44Q5SSM3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgap44Q5SSM3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Arhgap44Q5SSM3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Arhgap44Q5SSM3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgap44Q5SSM3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgap44Q5SSM3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgap44Q5SSM3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgap44Q5SSM3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgap44Q5SSM3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgap44Q5SSM3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgap44Q5SSM3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgap44Q5SSM3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgap44Q5SSM3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgap44Q5SSM3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgap44Q5SSM3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgap44Q5SSM3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgap44Q5SSM3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgap44Q5SSM3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.4 ms