Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIK3CD-AS1Q5SR53 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms