Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rapgef6Q5NCJ1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rapgef6Q5NCJ1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Rapgef6Q5NCJ1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Rapgef6Q5NCJ1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Rapgef6Q5NCJ1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Rapgef6Q5NCJ1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Rapgef6Q5NCJ1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Rapgef6Q5NCJ1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Rapgef6Q5NCJ1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Rapgef6Q5NCJ1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rapgef6Q5NCJ1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Rapgef6Q5NCJ1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rapgef6Q5NCJ1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Rapgef6Q5NCJ1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Rapgef6Q5NCJ1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Rapgef6Q5NCJ1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Rapgef6Q5NCJ1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Rapgef6Q5NCJ1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Rapgef6Q5NCJ1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Rapgef6Q5NCJ1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rapgef6Q5NCJ1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rapgef6Q5NCJ1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rapgef6Q5NCJ1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rapgef6Q5NCJ1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rapgef6Q5NCJ1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rapgef6Q5NCJ1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Rapgef6Q5NCJ1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rapgef6Q5NCJ1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rapgef6Q5NCJ1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rapgef6Q5NCJ1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rapgef6Q5NCJ1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rapgef6Q5NCJ1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rapgef6Q5NCJ1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rapgef6Q5NCJ1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rapgef6Q5NCJ1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Rapgef6Q5NCJ1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rapgef6Q5NCJ1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rapgef6Q5NCJ1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rapgef6Q5NCJ1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rapgef6Q5NCJ1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rapgef6Q5NCJ1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rapgef6Q5NCJ1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rapgef6Q5NCJ1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rapgef6Q5NCJ1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Rapgef6Q5NCJ1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Rapgef6Q5NCJ1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Rapgef6Q5NCJ1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Rapgef6Q5NCJ1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Rapgef6Q5NCJ1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rapgef6Q5NCJ1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rapgef6Q5NCJ1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Rapgef6Q5NCJ1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rapgef6Q5NCJ1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rapgef6Q5NCJ1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rapgef6Q5NCJ1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rapgef6Q5NCJ1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rapgef6Q5NCJ1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rapgef6Q5NCJ1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rapgef6Q5NCJ1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rapgef6Q5NCJ1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rapgef6Q5NCJ1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Rapgef6Q5NCJ1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rapgef6Q5NCJ1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rapgef6Q5NCJ1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Rapgef6Q5NCJ1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rapgef6Q5NCJ1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rapgef6Q5NCJ1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rapgef6Q5NCJ1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Rapgef6Q5NCJ1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rapgef6Q5NCJ1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rapgef6Q5NCJ1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Rapgef6Q5NCJ1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Rapgef6Q5NCJ1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Rapgef6Q5NCJ1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Rapgef6Q5NCJ1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Rapgef6Q5NCJ1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Rapgef6Q5NCJ1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Rapgef6Q5NCJ1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rapgef6Q5NCJ1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rapgef6Q5NCJ1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rapgef6Q5NCJ1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rapgef6Q5NCJ1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rapgef6Q5NCJ1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rapgef6Q5NCJ1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rapgef6Q5NCJ1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rapgef6Q5NCJ1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rapgef6Q5NCJ1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rapgef6Q5NCJ1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rapgef6Q5NCJ1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rapgef6Q5NCJ1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rapgef6Q5NCJ1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rapgef6Q5NCJ1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms