Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPANXN3Q5MJ09 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPANXN3Q5MJ09 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms