Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trpm3Q5F4S9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trpm3Q5F4S9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trpm3Q5F4S9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trpm3Q5F4S9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trpm3Q5F4S9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trpm3Q5F4S9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trpm3Q5F4S9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trpm3Q5F4S9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trpm3Q5F4S9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trpm3Q5F4S9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trpm3Q5F4S9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trpm3Q5F4S9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trpm3Q5F4S9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trpm3Q5F4S9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trpm3Q5F4S9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Trpm3Q5F4S9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trpm3Q5F4S9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Trpm3Q5F4S9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trpm3Q5F4S9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trpm3Q5F4S9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trpm3Q5F4S9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trpm3Q5F4S9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trpm3Q5F4S9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trpm3Q5F4S9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trpm3Q5F4S9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trpm3Q5F4S9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trpm3Q5F4S9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trpm3Q5F4S9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Trpm3Q5F4S9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trpm3Q5F4S9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trpm3Q5F4S9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trpm3Q5F4S9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trpm3Q5F4S9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trpm3Q5F4S9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trpm3Q5F4S9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trpm3Q5F4S9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trpm3Q5F4S9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trpm3Q5F4S9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trpm3Q5F4S9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Trpm3Q5F4S9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trpm3Q5F4S9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Trpm3Q5F4S9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Trpm3Q5F4S9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trpm3Q5F4S9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trpm3Q5F4S9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trpm3Q5F4S9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Trpm3Q5F4S9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trpm3Q5F4S9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trpm3Q5F4S9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trpm3Q5F4S9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trpm3Q5F4S9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trpm3Q5F4S9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trpm3Q5F4S9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Trpm3Q5F4S9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Trpm3Q5F4S9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Trpm3Q5F4S9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Trpm3Q5F4S9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Trpm3Q5F4S9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trpm3Q5F4S9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trpm3Q5F4S9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trpm3Q5F4S9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trpm3Q5F4S9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trpm3Q5F4S9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trpm3Q5F4S9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trpm3Q5F4S9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trpm3Q5F4S9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trpm3Q5F4S9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trpm3Q5F4S9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trpm3Q5F4S9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trpm3Q5F4S9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trpm3Q5F4S9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Trpm3Q5F4S9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trpm3Q5F4S9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trpm3Q5F4S9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trpm3Q5F4S9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trpm3Q5F4S9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trpm3Q5F4S9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trpm3Q5F4S9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trpm3Q5F4S9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trpm3Q5F4S9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Trpm3Q5F4S9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trpm3Q5F4S9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trpm3Q5F4S9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trpm3Q5F4S9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trpm3Q5F4S9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trpm3Q5F4S9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trpm3Q5F4S9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trpm3Q5F4S9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trpm3Q5F4S9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trpm3Q5F4S9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trpm3Q5F4S9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Trpm3Q5F4S9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trpm3Q5F4S9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trpm3Q5F4S9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trpm3Q5F4S9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trpm3Q5F4S9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trpm3Q5F4S9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trpm3Q5F4S9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trpm3Q5F4S9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms