Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU05

Cep164, Centrosomal protein of 164 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep164Q5DU05 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Cep164Q5DU05 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
Cep164Q5DU05 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Cep164Q5DU05 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Cep164Q5DU05 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Cep164Q5DU05 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Cep164Q5DU05 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Cep164Q5DU05 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
Cep164Q5DU05 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Cep164Q5DU05 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Cep164Q5DU05 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
Cep164Q5DU05 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Cep164Q5DU05 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Cep164Q5DU05 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Cep164Q5DU05 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Cep164Q5DU05 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Cep164Q5DU05 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Cep164Q5DU05 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Cep164Q5DU05 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Cep164Q5DU05 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Cep164Q5DU05 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Cep164Q5DU05 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Cep164Q5DU05 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Cep164Q5DU05 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Cep164Q5DU05 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Cep164Q5DU05 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Cep164Q5DU05 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Cep164Q5DU05 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Cep164Q5DU05 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
Cep164Q5DU05 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Cep164Q5DU05 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Cep164Q5DU05 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Cep164Q5DU05 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Cep164Q5DU05 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Cep164Q5DU05 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Cep164Q5DU05 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Cep164Q5DU05 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Cep164Q5DU05 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Cep164Q5DU05 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Cep164Q5DU05 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Cep164Q5DU05 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Cep164Q5DU05 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Cep164Q5DU05 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Cep164Q5DU05 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Cep164Q5DU05 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Cep164Q5DU05 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
Cep164Q5DU05 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Cep164Q5DU05 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Cep164Q5DU05 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Cep164Q5DU05 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Cep164Q5DU05 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Cep164Q5DU05 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Cep164Q5DU05 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Cep164Q5DU05 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Cep164Q5DU05 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Cep164Q5DU05 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Cep164Q5DU05 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Cep164Q5DU05 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Cep164Q5DU05 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Cep164Q5DU05 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Cep164Q5DU05 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Cep164Q5DU05 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Cep164Q5DU05 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Cep164Q5DU05 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Cep164Q5DU05 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Cep164Q5DU05 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Cep164Q5DU05 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Cep164Q5DU05 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Cep164Q5DU05 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Cep164Q5DU05 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Cep164Q5DU05 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Cep164Q5DU05 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Cep164Q5DU05 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Cep164Q5DU05 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.66
Cep164Q5DU05 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
Cep164Q5DU05 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Cep164Q5DU05 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Cep164Q5DU05 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Cep164Q5DU05 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Cep164Q5DU05 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Cep164Q5DU05 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Cep164Q5DU05 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Cep164Q5DU05 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Cep164Q5DU05 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Cep164Q5DU05 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Cep164Q5DU05 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Cep164Q5DU05 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Cep164Q5DU05 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Cep164Q5DU05 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Cep164Q5DU05 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Cep164Q5DU05 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Cep164Q5DU05 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Cep164Q5DU05 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Cep164Q5DU05 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Cep164Q5DU05 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
Cep164Q5DU05 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC37.82■■■■□ 3.65
Cep164Q5DU05 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
Cep164Q5DU05 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Cep164Q5DU05 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
Cep164Q5DU05 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms