Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPAT3Q53EU6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPAT3Q53EU6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPAT3Q53EU6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms