Protein–RNA interactions for Protein: Q52KI8

Srrm1, Serine/arginine repetitive matrix protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm1Q52KI8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Srrm1Q52KI8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srrm1Q52KI8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srrm1Q52KI8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srrm1Q52KI8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Srrm1Q52KI8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srrm1Q52KI8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srrm1Q52KI8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srrm1Q52KI8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srrm1Q52KI8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srrm1Q52KI8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srrm1Q52KI8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srrm1Q52KI8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Srrm1Q52KI8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Srrm1Q52KI8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Srrm1Q52KI8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Srrm1Q52KI8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Srrm1Q52KI8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Srrm1Q52KI8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Srrm1Q52KI8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Srrm1Q52KI8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Srrm1Q52KI8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Srrm1Q52KI8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Srrm1Q52KI8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Srrm1Q52KI8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Srrm1Q52KI8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Srrm1Q52KI8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Srrm1Q52KI8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Srrm1Q52KI8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srrm1Q52KI8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Srrm1Q52KI8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srrm1Q52KI8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srrm1Q52KI8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srrm1Q52KI8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srrm1Q52KI8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srrm1Q52KI8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Srrm1Q52KI8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Srrm1Q52KI8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Srrm1Q52KI8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Srrm1Q52KI8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Srrm1Q52KI8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Srrm1Q52KI8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Srrm1Q52KI8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Srrm1Q52KI8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Srrm1Q52KI8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Srrm1Q52KI8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Srrm1Q52KI8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Srrm1Q52KI8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Srrm1Q52KI8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Srrm1Q52KI8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Srrm1Q52KI8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Srrm1Q52KI8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Srrm1Q52KI8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Srrm1Q52KI8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Srrm1Q52KI8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Srrm1Q52KI8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Srrm1Q52KI8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Srrm1Q52KI8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Srrm1Q52KI8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Srrm1Q52KI8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Srrm1Q52KI8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Srrm1Q52KI8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Srrm1Q52KI8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Srrm1Q52KI8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Srrm1Q52KI8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Srrm1Q52KI8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms