Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KHDC1Q4VXA5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KHDC1Q4VXA5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KHDC1Q4VXA5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KHDC1Q4VXA5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KHDC1Q4VXA5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KHDC1Q4VXA5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KHDC1Q4VXA5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KHDC1Q4VXA5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KHDC1Q4VXA5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KHDC1Q4VXA5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KHDC1Q4VXA5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KHDC1Q4VXA5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KHDC1Q4VXA5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KHDC1Q4VXA5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KHDC1Q4VXA5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KHDC1Q4VXA5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KHDC1Q4VXA5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KHDC1Q4VXA5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KHDC1Q4VXA5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KHDC1Q4VXA5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KHDC1Q4VXA5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KHDC1Q4VXA5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KHDC1Q4VXA5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KHDC1Q4VXA5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KHDC1Q4VXA5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KHDC1Q4VXA5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KHDC1Q4VXA5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KHDC1Q4VXA5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KHDC1Q4VXA5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KHDC1Q4VXA5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KHDC1Q4VXA5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KHDC1Q4VXA5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KHDC1Q4VXA5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KHDC1Q4VXA5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms