Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA45

Uncharacterized protein C11orf95 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q4VA45 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Q4VA45 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Q4VA45 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Q4VA45 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Q4VA45 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Q4VA45 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Q4VA45 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Q4VA45 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Q4VA45 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Q4VA45 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Q4VA45 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Q4VA45 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Q4VA45 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Q4VA45 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Q4VA45 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Q4VA45 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Q4VA45 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Q4VA45 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Q4VA45 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Q4VA45 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Q4VA45 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Q4VA45 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Q4VA45 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Q4VA45 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Q4VA45 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Q4VA45 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Q4VA45 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Q4VA45 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Q4VA45 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Q4VA45 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Q4VA45 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Q4VA45 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Q4VA45 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Q4VA45 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Q4VA45 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Q4VA45 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Q4VA45 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Q4VA45 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Q4VA45 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Q4VA45 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Q4VA45 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Q4VA45 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Q4VA45 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Q4VA45 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Q4VA45 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Q4VA45 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Q4VA45 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Q4VA45 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Q4VA45 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Q4VA45 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Q4VA45 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Q4VA45 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Q4VA45 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Q4VA45 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Q4VA45 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Q4VA45 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Q4VA45 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Q4VA45 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Q4VA45 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Q4VA45 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Q4VA45 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Q4VA45 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Q4VA45 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Q4VA45 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Q4VA45 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Q4VA45 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Q4VA45 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Q4VA45 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Q4VA45 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Q4VA45 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Q4VA45 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Q4VA45 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Q4VA45 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Q4VA45 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Q4VA45 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Q4VA45 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Q4VA45 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Q4VA45 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Q4VA45 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Q4VA45 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Q4VA45 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Q4VA45 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Q4VA45 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Q4VA45 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Q4VA45 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Q4VA45 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Q4VA45 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Q4VA45 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Q4VA45 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Q4VA45 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Q4VA45 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Q4VA45 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Q4VA45 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Q4VA45 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Q4VA45 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Q4VA45 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Q4VA45 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Q4VA45 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Q4VA45 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Q4VA45 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms