Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smim26Q3V460 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim26Q3V460 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim26Q3V460 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms