Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Afg1lQ3V384 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Afg1lQ3V384 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Afg1lQ3V384 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Afg1lQ3V384 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Afg1lQ3V384 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Afg1lQ3V384 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Afg1lQ3V384 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Afg1lQ3V384 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Afg1lQ3V384 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Afg1lQ3V384 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Afg1lQ3V384 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Afg1lQ3V384 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Afg1lQ3V384 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Afg1lQ3V384 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Afg1lQ3V384 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Afg1lQ3V384 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Afg1lQ3V384 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Afg1lQ3V384 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Afg1lQ3V384 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Afg1lQ3V384 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Afg1lQ3V384 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Afg1lQ3V384 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Afg1lQ3V384 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Afg1lQ3V384 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Afg1lQ3V384 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Afg1lQ3V384 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Afg1lQ3V384 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Afg1lQ3V384 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Afg1lQ3V384 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Afg1lQ3V384 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Afg1lQ3V384 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Afg1lQ3V384 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Afg1lQ3V384 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Afg1lQ3V384 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Afg1lQ3V384 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Afg1lQ3V384 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Afg1lQ3V384 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms