Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZY0

Sfi1, Protein SFI1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfi1Q3UZY0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sfi1Q3UZY0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sfi1Q3UZY0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sfi1Q3UZY0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sfi1Q3UZY0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sfi1Q3UZY0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sfi1Q3UZY0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sfi1Q3UZY0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sfi1Q3UZY0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sfi1Q3UZY0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Sfi1Q3UZY0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sfi1Q3UZY0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sfi1Q3UZY0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sfi1Q3UZY0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sfi1Q3UZY0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sfi1Q3UZY0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sfi1Q3UZY0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sfi1Q3UZY0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sfi1Q3UZY0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sfi1Q3UZY0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sfi1Q3UZY0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sfi1Q3UZY0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sfi1Q3UZY0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sfi1Q3UZY0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sfi1Q3UZY0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sfi1Q3UZY0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Sfi1Q3UZY0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sfi1Q3UZY0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sfi1Q3UZY0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sfi1Q3UZY0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sfi1Q3UZY0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Sfi1Q3UZY0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sfi1Q3UZY0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sfi1Q3UZY0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sfi1Q3UZY0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sfi1Q3UZY0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sfi1Q3UZY0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sfi1Q3UZY0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sfi1Q3UZY0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sfi1Q3UZY0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sfi1Q3UZY0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sfi1Q3UZY0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sfi1Q3UZY0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sfi1Q3UZY0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sfi1Q3UZY0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sfi1Q3UZY0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Sfi1Q3UZY0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sfi1Q3UZY0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sfi1Q3UZY0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sfi1Q3UZY0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sfi1Q3UZY0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sfi1Q3UZY0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sfi1Q3UZY0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sfi1Q3UZY0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sfi1Q3UZY0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Sfi1Q3UZY0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sfi1Q3UZY0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sfi1Q3UZY0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Sfi1Q3UZY0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sfi1Q3UZY0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sfi1Q3UZY0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sfi1Q3UZY0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sfi1Q3UZY0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sfi1Q3UZY0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sfi1Q3UZY0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sfi1Q3UZY0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sfi1Q3UZY0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Sfi1Q3UZY0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sfi1Q3UZY0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sfi1Q3UZY0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sfi1Q3UZY0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sfi1Q3UZY0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sfi1Q3UZY0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sfi1Q3UZY0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sfi1Q3UZY0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sfi1Q3UZY0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sfi1Q3UZY0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sfi1Q3UZY0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sfi1Q3UZY0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sfi1Q3UZY0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sfi1Q3UZY0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sfi1Q3UZY0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sfi1Q3UZY0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sfi1Q3UZY0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sfi1Q3UZY0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sfi1Q3UZY0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sfi1Q3UZY0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sfi1Q3UZY0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sfi1Q3UZY0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sfi1Q3UZY0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sfi1Q3UZY0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sfi1Q3UZY0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sfi1Q3UZY0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sfi1Q3UZY0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sfi1Q3UZY0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sfi1Q3UZY0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sfi1Q3UZY0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sfi1Q3UZY0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sfi1Q3UZY0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sfi1Q3UZY0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms