Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZA1

Rcsd1, CapZ-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcsd1Q3UZA1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rcsd1Q3UZA1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rcsd1Q3UZA1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rcsd1Q3UZA1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rcsd1Q3UZA1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rcsd1Q3UZA1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rcsd1Q3UZA1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rcsd1Q3UZA1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rcsd1Q3UZA1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rcsd1Q3UZA1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rcsd1Q3UZA1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rcsd1Q3UZA1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rcsd1Q3UZA1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rcsd1Q3UZA1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rcsd1Q3UZA1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rcsd1Q3UZA1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rcsd1Q3UZA1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rcsd1Q3UZA1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rcsd1Q3UZA1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rcsd1Q3UZA1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rcsd1Q3UZA1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rcsd1Q3UZA1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rcsd1Q3UZA1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rcsd1Q3UZA1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rcsd1Q3UZA1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rcsd1Q3UZA1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rcsd1Q3UZA1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rcsd1Q3UZA1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rcsd1Q3UZA1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rcsd1Q3UZA1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rcsd1Q3UZA1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rcsd1Q3UZA1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rcsd1Q3UZA1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rcsd1Q3UZA1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rcsd1Q3UZA1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rcsd1Q3UZA1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rcsd1Q3UZA1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rcsd1Q3UZA1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rcsd1Q3UZA1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rcsd1Q3UZA1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rcsd1Q3UZA1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rcsd1Q3UZA1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rcsd1Q3UZA1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rcsd1Q3UZA1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rcsd1Q3UZA1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rcsd1Q3UZA1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rcsd1Q3UZA1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rcsd1Q3UZA1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rcsd1Q3UZA1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rcsd1Q3UZA1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rcsd1Q3UZA1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rcsd1Q3UZA1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rcsd1Q3UZA1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rcsd1Q3UZA1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rcsd1Q3UZA1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rcsd1Q3UZA1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rcsd1Q3UZA1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rcsd1Q3UZA1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rcsd1Q3UZA1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rcsd1Q3UZA1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rcsd1Q3UZA1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rcsd1Q3UZA1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rcsd1Q3UZA1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rcsd1Q3UZA1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rcsd1Q3UZA1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rcsd1Q3UZA1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rcsd1Q3UZA1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rcsd1Q3UZA1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rcsd1Q3UZA1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rcsd1Q3UZA1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rcsd1Q3UZA1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rcsd1Q3UZA1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rcsd1Q3UZA1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rcsd1Q3UZA1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rcsd1Q3UZA1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rcsd1Q3UZA1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rcsd1Q3UZA1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rcsd1Q3UZA1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rcsd1Q3UZA1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rcsd1Q3UZA1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rcsd1Q3UZA1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rcsd1Q3UZA1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rcsd1Q3UZA1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rcsd1Q3UZA1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rcsd1Q3UZA1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rcsd1Q3UZA1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rcsd1Q3UZA1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rcsd1Q3UZA1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rcsd1Q3UZA1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rcsd1Q3UZA1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rcsd1Q3UZA1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rcsd1Q3UZA1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rcsd1Q3UZA1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rcsd1Q3UZA1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rcsd1Q3UZA1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rcsd1Q3UZA1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rcsd1Q3UZA1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rcsd1Q3UZA1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rcsd1Q3UZA1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rcsd1Q3UZA1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms