Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Acsf3Q3URE1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acsf3Q3URE1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acsf3Q3URE1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acsf3Q3URE1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acsf3Q3URE1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acsf3Q3URE1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acsf3Q3URE1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acsf3Q3URE1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acsf3Q3URE1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acsf3Q3URE1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acsf3Q3URE1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acsf3Q3URE1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acsf3Q3URE1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acsf3Q3URE1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acsf3Q3URE1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acsf3Q3URE1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acsf3Q3URE1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acsf3Q3URE1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acsf3Q3URE1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acsf3Q3URE1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acsf3Q3URE1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acsf3Q3URE1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acsf3Q3URE1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acsf3Q3URE1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acsf3Q3URE1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acsf3Q3URE1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acsf3Q3URE1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acsf3Q3URE1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acsf3Q3URE1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acsf3Q3URE1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acsf3Q3URE1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acsf3Q3URE1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Acsf3Q3URE1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acsf3Q3URE1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acsf3Q3URE1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acsf3Q3URE1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acsf3Q3URE1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Acsf3Q3URE1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Acsf3Q3URE1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Acsf3Q3URE1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Acsf3Q3URE1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Acsf3Q3URE1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Acsf3Q3URE1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Acsf3Q3URE1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Acsf3Q3URE1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Acsf3Q3URE1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acsf3Q3URE1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acsf3Q3URE1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acsf3Q3URE1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acsf3Q3URE1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acsf3Q3URE1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acsf3Q3URE1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acsf3Q3URE1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acsf3Q3URE1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acsf3Q3URE1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Acsf3Q3URE1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Acsf3Q3URE1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Acsf3Q3URE1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acsf3Q3URE1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Acsf3Q3URE1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acsf3Q3URE1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acsf3Q3URE1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acsf3Q3URE1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acsf3Q3URE1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acsf3Q3URE1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acsf3Q3URE1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Acsf3Q3URE1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Acsf3Q3URE1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Acsf3Q3URE1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acsf3Q3URE1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acsf3Q3URE1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acsf3Q3URE1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acsf3Q3URE1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Acsf3Q3URE1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Acsf3Q3URE1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Acsf3Q3URE1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Acsf3Q3URE1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Acsf3Q3URE1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Acsf3Q3URE1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acsf3Q3URE1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acsf3Q3URE1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acsf3Q3URE1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acsf3Q3URE1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acsf3Q3URE1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acsf3Q3URE1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acsf3Q3URE1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Acsf3Q3URE1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Acsf3Q3URE1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acsf3Q3URE1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acsf3Q3URE1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acsf3Q3URE1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Acsf3Q3URE1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acsf3Q3URE1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acsf3Q3URE1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acsf3Q3URE1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Acsf3Q3URE1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Acsf3Q3URE1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Acsf3Q3URE1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Acsf3Q3URE1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms