Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp36Q3UFY0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp36Q3UFY0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp36Q3UFY0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp36Q3UFY0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp36Q3UFY0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp36Q3UFY0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp36Q3UFY0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp36Q3UFY0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp36Q3UFY0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp36Q3UFY0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp36Q3UFY0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp36Q3UFY0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp36Q3UFY0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp36Q3UFY0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp36Q3UFY0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp36Q3UFY0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp36Q3UFY0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp36Q3UFY0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp36Q3UFY0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp36Q3UFY0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp36Q3UFY0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp36Q3UFY0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp36Q3UFY0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrp36Q3UFY0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrp36Q3UFY0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrp36Q3UFY0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrp36Q3UFY0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrp36Q3UFY0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrp36Q3UFY0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrp36Q3UFY0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrp36Q3UFY0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrp36Q3UFY0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrp36Q3UFY0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrp36Q3UFY0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrp36Q3UFY0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrp36Q3UFY0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrp36Q3UFY0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrp36Q3UFY0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrp36Q3UFY0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrp36Q3UFY0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrp36Q3UFY0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrp36Q3UFY0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrp36Q3UFY0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrp36Q3UFY0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrp36Q3UFY0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrp36Q3UFY0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrp36Q3UFY0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrp36Q3UFY0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrp36Q3UFY0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrp36Q3UFY0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rrp36Q3UFY0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rrp36Q3UFY0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp36Q3UFY0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp36Q3UFY0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp36Q3UFY0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp36Q3UFY0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp36Q3UFY0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp36Q3UFY0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp36Q3UFY0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp36Q3UFY0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp36Q3UFY0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp36Q3UFY0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp36Q3UFY0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp36Q3UFY0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp36Q3UFY0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp36Q3UFY0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp36Q3UFY0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp36Q3UFY0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp36Q3UFY0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp36Q3UFY0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp36Q3UFY0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp36Q3UFY0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp36Q3UFY0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp36Q3UFY0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp36Q3UFY0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp36Q3UFY0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp36Q3UFY0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp36Q3UFY0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp36Q3UFY0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp36Q3UFY0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrp36Q3UFY0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrp36Q3UFY0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrp36Q3UFY0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rrp36Q3UFY0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rrp36Q3UFY0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp36Q3UFY0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp36Q3UFY0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp36Q3UFY0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrp36Q3UFY0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrp36Q3UFY0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrp36Q3UFY0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrp36Q3UFY0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp36Q3UFY0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp36Q3UFY0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp36Q3UFY0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp36Q3UFY0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp36Q3UFY0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp36Q3UFY0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp36Q3UFY0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms