Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nom1Q3UFM5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nom1Q3UFM5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nom1Q3UFM5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nom1Q3UFM5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nom1Q3UFM5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nom1Q3UFM5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Nom1Q3UFM5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nom1Q3UFM5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nom1Q3UFM5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nom1Q3UFM5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nom1Q3UFM5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nom1Q3UFM5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Nom1Q3UFM5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nom1Q3UFM5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nom1Q3UFM5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nom1Q3UFM5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nom1Q3UFM5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nom1Q3UFM5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nom1Q3UFM5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nom1Q3UFM5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Nom1Q3UFM5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nom1Q3UFM5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nom1Q3UFM5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nom1Q3UFM5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nom1Q3UFM5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nom1Q3UFM5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nom1Q3UFM5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nom1Q3UFM5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nom1Q3UFM5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nom1Q3UFM5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nom1Q3UFM5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nom1Q3UFM5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nom1Q3UFM5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nom1Q3UFM5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nom1Q3UFM5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nom1Q3UFM5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nom1Q3UFM5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nom1Q3UFM5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nom1Q3UFM5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nom1Q3UFM5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nom1Q3UFM5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nom1Q3UFM5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nom1Q3UFM5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nom1Q3UFM5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nom1Q3UFM5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nom1Q3UFM5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nom1Q3UFM5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nom1Q3UFM5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nom1Q3UFM5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nom1Q3UFM5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nom1Q3UFM5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nom1Q3UFM5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nom1Q3UFM5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nom1Q3UFM5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nom1Q3UFM5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nom1Q3UFM5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nom1Q3UFM5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nom1Q3UFM5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nom1Q3UFM5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms