Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VwceQ3U515 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VwceQ3U515 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VwceQ3U515 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VwceQ3U515 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VwceQ3U515 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VwceQ3U515 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VwceQ3U515 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VwceQ3U515 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VwceQ3U515 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VwceQ3U515 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VwceQ3U515 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VwceQ3U515 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VwceQ3U515 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VwceQ3U515 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VwceQ3U515 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VwceQ3U515 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VwceQ3U515 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VwceQ3U515 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VwceQ3U515 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VwceQ3U515 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VwceQ3U515 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VwceQ3U515 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VwceQ3U515 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VwceQ3U515 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VwceQ3U515 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VwceQ3U515 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
VwceQ3U515 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VwceQ3U515 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VwceQ3U515 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VwceQ3U515 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VwceQ3U515 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VwceQ3U515 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VwceQ3U515 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VwceQ3U515 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VwceQ3U515 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VwceQ3U515 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VwceQ3U515 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VwceQ3U515 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VwceQ3U515 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VwceQ3U515 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VwceQ3U515 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VwceQ3U515 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VwceQ3U515 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VwceQ3U515 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VwceQ3U515 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VwceQ3U515 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
VwceQ3U515 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VwceQ3U515 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VwceQ3U515 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VwceQ3U515 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VwceQ3U515 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VwceQ3U515 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VwceQ3U515 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VwceQ3U515 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
VwceQ3U515 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VwceQ3U515 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VwceQ3U515 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VwceQ3U515 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VwceQ3U515 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VwceQ3U515 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VwceQ3U515 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VwceQ3U515 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VwceQ3U515 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VwceQ3U515 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VwceQ3U515 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VwceQ3U515 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VwceQ3U515 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms