Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam117bQ3U3E2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam117bQ3U3E2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam117bQ3U3E2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam117bQ3U3E2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam117bQ3U3E2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam117bQ3U3E2 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam117bQ3U3E2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam117bQ3U3E2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam117bQ3U3E2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam117bQ3U3E2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam117bQ3U3E2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam117bQ3U3E2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam117bQ3U3E2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam117bQ3U3E2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam117bQ3U3E2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam117bQ3U3E2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam117bQ3U3E2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam117bQ3U3E2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam117bQ3U3E2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam117bQ3U3E2 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fam117bQ3U3E2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam117bQ3U3E2 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam117bQ3U3E2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam117bQ3U3E2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.31■■□□□ 1
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