Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1V6

Uevld, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UevldQ3U1V6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UevldQ3U1V6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UevldQ3U1V6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UevldQ3U1V6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UevldQ3U1V6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UevldQ3U1V6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UevldQ3U1V6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UevldQ3U1V6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UevldQ3U1V6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UevldQ3U1V6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UevldQ3U1V6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UevldQ3U1V6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UevldQ3U1V6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UevldQ3U1V6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UevldQ3U1V6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UevldQ3U1V6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
UevldQ3U1V6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UevldQ3U1V6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UevldQ3U1V6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UevldQ3U1V6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
UevldQ3U1V6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UevldQ3U1V6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UevldQ3U1V6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UevldQ3U1V6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UevldQ3U1V6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UevldQ3U1V6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UevldQ3U1V6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms