Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1J4

Ddb1, DNA damage-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb1Q3U1J4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ddb1Q3U1J4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Ddb1Q3U1J4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ddb1Q3U1J4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ddb1Q3U1J4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ddb1Q3U1J4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ddb1Q3U1J4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ddb1Q3U1J4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ddb1Q3U1J4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ddb1Q3U1J4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Ddb1Q3U1J4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ddb1Q3U1J4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ddb1Q3U1J4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ddb1Q3U1J4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ddb1Q3U1J4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ddb1Q3U1J4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ddb1Q3U1J4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ddb1Q3U1J4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ddb1Q3U1J4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ddb1Q3U1J4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ddb1Q3U1J4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ddb1Q3U1J4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ddb1Q3U1J4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ddb1Q3U1J4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ddb1Q3U1J4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ddb1Q3U1J4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ddb1Q3U1J4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ddb1Q3U1J4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Ddb1Q3U1J4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ddb1Q3U1J4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ddb1Q3U1J4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ddb1Q3U1J4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ddb1Q3U1J4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ddb1Q3U1J4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ddb1Q3U1J4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ddb1Q3U1J4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ddb1Q3U1J4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ddb1Q3U1J4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ddb1Q3U1J4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ddb1Q3U1J4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ddb1Q3U1J4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ddb1Q3U1J4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ddb1Q3U1J4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ddb1Q3U1J4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ddb1Q3U1J4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ddb1Q3U1J4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ddb1Q3U1J4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ddb1Q3U1J4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ddb1Q3U1J4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ddb1Q3U1J4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ddb1Q3U1J4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Ddb1Q3U1J4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ddb1Q3U1J4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ddb1Q3U1J4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ddb1Q3U1J4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ddb1Q3U1J4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ddb1Q3U1J4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ddb1Q3U1J4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ddb1Q3U1J4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ddb1Q3U1J4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ddb1Q3U1J4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ddb1Q3U1J4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ddb1Q3U1J4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ddb1Q3U1J4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ddb1Q3U1J4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ddb1Q3U1J4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ddb1Q3U1J4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ddb1Q3U1J4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ddb1Q3U1J4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ddb1Q3U1J4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ddb1Q3U1J4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ddb1Q3U1J4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ddb1Q3U1J4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ddb1Q3U1J4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ddb1Q3U1J4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ddb1Q3U1J4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ddb1Q3U1J4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ddb1Q3U1J4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ddb1Q3U1J4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Ddb1Q3U1J4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Ddb1Q3U1J4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Ddb1Q3U1J4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ddb1Q3U1J4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Ddb1Q3U1J4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ddb1Q3U1J4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ddb1Q3U1J4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ddb1Q3U1J4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ddb1Q3U1J4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ddb1Q3U1J4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ddb1Q3U1J4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ddb1Q3U1J4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ddb1Q3U1J4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ddb1Q3U1J4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ddb1Q3U1J4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Ddb1Q3U1J4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ddb1Q3U1J4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ddb1Q3U1J4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ddb1Q3U1J4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ddb1Q3U1J4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ddb1Q3U1J4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms