Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1C6

Tatdn3, Putative deoxyribonuclease TATDN3, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tatdn3Q3U1C6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tatdn3Q3U1C6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tatdn3Q3U1C6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tatdn3Q3U1C6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tatdn3Q3U1C6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tatdn3Q3U1C6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tatdn3Q3U1C6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tatdn3Q3U1C6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tatdn3Q3U1C6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tatdn3Q3U1C6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tatdn3Q3U1C6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tatdn3Q3U1C6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tatdn3Q3U1C6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tatdn3Q3U1C6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tatdn3Q3U1C6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tatdn3Q3U1C6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tatdn3Q3U1C6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tatdn3Q3U1C6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tatdn3Q3U1C6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tatdn3Q3U1C6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tatdn3Q3U1C6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tatdn3Q3U1C6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tatdn3Q3U1C6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tatdn3Q3U1C6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tatdn3Q3U1C6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tatdn3Q3U1C6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tatdn3Q3U1C6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tatdn3Q3U1C6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tatdn3Q3U1C6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tatdn3Q3U1C6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tatdn3Q3U1C6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tatdn3Q3U1C6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tatdn3Q3U1C6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tatdn3Q3U1C6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tatdn3Q3U1C6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tatdn3Q3U1C6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tatdn3Q3U1C6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tatdn3Q3U1C6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tatdn3Q3U1C6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tatdn3Q3U1C6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tatdn3Q3U1C6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tatdn3Q3U1C6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tatdn3Q3U1C6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tatdn3Q3U1C6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tatdn3Q3U1C6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tatdn3Q3U1C6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tatdn3Q3U1C6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tatdn3Q3U1C6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tatdn3Q3U1C6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tatdn3Q3U1C6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tatdn3Q3U1C6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tatdn3Q3U1C6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tatdn3Q3U1C6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tatdn3Q3U1C6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tatdn3Q3U1C6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tatdn3Q3U1C6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tatdn3Q3U1C6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tatdn3Q3U1C6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tatdn3Q3U1C6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tatdn3Q3U1C6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tatdn3Q3U1C6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tatdn3Q3U1C6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tatdn3Q3U1C6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tatdn3Q3U1C6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tatdn3Q3U1C6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tatdn3Q3U1C6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tatdn3Q3U1C6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms