Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TraddQ3U0V2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TraddQ3U0V2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TraddQ3U0V2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TraddQ3U0V2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TraddQ3U0V2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TraddQ3U0V2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TraddQ3U0V2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TraddQ3U0V2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TraddQ3U0V2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TraddQ3U0V2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TraddQ3U0V2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TraddQ3U0V2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TraddQ3U0V2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TraddQ3U0V2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TraddQ3U0V2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TraddQ3U0V2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TraddQ3U0V2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TraddQ3U0V2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TraddQ3U0V2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TraddQ3U0V2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TraddQ3U0V2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TraddQ3U0V2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TraddQ3U0V2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TraddQ3U0V2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TraddQ3U0V2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TraddQ3U0V2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TraddQ3U0V2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TraddQ3U0V2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TraddQ3U0V2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TraddQ3U0V2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TraddQ3U0V2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TraddQ3U0V2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TraddQ3U0V2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TraddQ3U0V2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TraddQ3U0V2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TraddQ3U0V2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TraddQ3U0V2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TraddQ3U0V2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TraddQ3U0V2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TraddQ3U0V2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TraddQ3U0V2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TraddQ3U0V2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TraddQ3U0V2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TraddQ3U0V2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TraddQ3U0V2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TraddQ3U0V2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TraddQ3U0V2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TraddQ3U0V2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TraddQ3U0V2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TraddQ3U0V2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TraddQ3U0V2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TraddQ3U0V2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TraddQ3U0V2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TraddQ3U0V2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TraddQ3U0V2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TraddQ3U0V2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TraddQ3U0V2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TraddQ3U0V2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TraddQ3U0V2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TraddQ3U0V2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TraddQ3U0V2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TraddQ3U0V2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TraddQ3U0V2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TraddQ3U0V2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TraddQ3U0V2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TraddQ3U0V2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TraddQ3U0V2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TraddQ3U0V2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TraddQ3U0V2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TraddQ3U0V2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TraddQ3U0V2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TraddQ3U0V2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TraddQ3U0V2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TraddQ3U0V2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TraddQ3U0V2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TraddQ3U0V2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TraddQ3U0V2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TraddQ3U0V2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TraddQ3U0V2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TraddQ3U0V2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TraddQ3U0V2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TraddQ3U0V2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TraddQ3U0V2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TraddQ3U0V2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TraddQ3U0V2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TraddQ3U0V2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TraddQ3U0V2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TraddQ3U0V2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TraddQ3U0V2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TraddQ3U0V2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TraddQ3U0V2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TraddQ3U0V2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TraddQ3U0V2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TraddQ3U0V2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TraddQ3U0V2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TraddQ3U0V2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TraddQ3U0V2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TraddQ3U0V2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TraddQ3U0V2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms