Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KhsrpQ3U0V1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KhsrpQ3U0V1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KhsrpQ3U0V1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KhsrpQ3U0V1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KhsrpQ3U0V1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
KhsrpQ3U0V1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KhsrpQ3U0V1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KhsrpQ3U0V1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KhsrpQ3U0V1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KhsrpQ3U0V1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KhsrpQ3U0V1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KhsrpQ3U0V1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KhsrpQ3U0V1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KhsrpQ3U0V1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KhsrpQ3U0V1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KhsrpQ3U0V1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KhsrpQ3U0V1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KhsrpQ3U0V1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KhsrpQ3U0V1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KhsrpQ3U0V1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KhsrpQ3U0V1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KhsrpQ3U0V1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KhsrpQ3U0V1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KhsrpQ3U0V1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KhsrpQ3U0V1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KhsrpQ3U0V1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KhsrpQ3U0V1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KhsrpQ3U0V1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KhsrpQ3U0V1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KhsrpQ3U0V1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KhsrpQ3U0V1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KhsrpQ3U0V1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KhsrpQ3U0V1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KhsrpQ3U0V1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KhsrpQ3U0V1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KhsrpQ3U0V1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KhsrpQ3U0V1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KhsrpQ3U0V1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KhsrpQ3U0V1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KhsrpQ3U0V1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KhsrpQ3U0V1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KhsrpQ3U0V1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KhsrpQ3U0V1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KhsrpQ3U0V1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KhsrpQ3U0V1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KhsrpQ3U0V1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KhsrpQ3U0V1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KhsrpQ3U0V1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KhsrpQ3U0V1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KhsrpQ3U0V1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KhsrpQ3U0V1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KhsrpQ3U0V1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KhsrpQ3U0V1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KhsrpQ3U0V1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KhsrpQ3U0V1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KhsrpQ3U0V1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KhsrpQ3U0V1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KhsrpQ3U0V1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KhsrpQ3U0V1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KhsrpQ3U0V1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KhsrpQ3U0V1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KhsrpQ3U0V1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KhsrpQ3U0V1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KhsrpQ3U0V1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KhsrpQ3U0V1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KhsrpQ3U0V1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KhsrpQ3U0V1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KhsrpQ3U0V1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KhsrpQ3U0V1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KhsrpQ3U0V1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KhsrpQ3U0V1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KhsrpQ3U0V1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KhsrpQ3U0V1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KhsrpQ3U0V1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KhsrpQ3U0V1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KhsrpQ3U0V1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KhsrpQ3U0V1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KhsrpQ3U0V1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KhsrpQ3U0V1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KhsrpQ3U0V1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KhsrpQ3U0V1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KhsrpQ3U0V1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KhsrpQ3U0V1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KhsrpQ3U0V1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KhsrpQ3U0V1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KhsrpQ3U0V1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KhsrpQ3U0V1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KhsrpQ3U0V1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KhsrpQ3U0V1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KhsrpQ3U0V1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KhsrpQ3U0V1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KhsrpQ3U0V1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KhsrpQ3U0V1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KhsrpQ3U0V1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KhsrpQ3U0V1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KhsrpQ3U0V1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KhsrpQ3U0V1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KhsrpQ3U0V1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KhsrpQ3U0V1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms