Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc9Q3U0M1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc9Q3U0M1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc9Q3U0M1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc9Q3U0M1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc9Q3U0M1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc9Q3U0M1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc9Q3U0M1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc9Q3U0M1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc9Q3U0M1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc9Q3U0M1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc9Q3U0M1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc9Q3U0M1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc9Q3U0M1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc9Q3U0M1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc9Q3U0M1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc9Q3U0M1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc9Q3U0M1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc9Q3U0M1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc9Q3U0M1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc9Q3U0M1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc9Q3U0M1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc9Q3U0M1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc9Q3U0M1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc9Q3U0M1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc9Q3U0M1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc9Q3U0M1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc9Q3U0M1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc9Q3U0M1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc9Q3U0M1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc9Q3U0M1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc9Q3U0M1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc9Q3U0M1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc9Q3U0M1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc9Q3U0M1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc9Q3U0M1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc9Q3U0M1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc9Q3U0M1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc9Q3U0M1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc9Q3U0M1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc9Q3U0M1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc9Q3U0M1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc9Q3U0M1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc9Q3U0M1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc9Q3U0M1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc9Q3U0M1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc9Q3U0M1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc9Q3U0M1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc9Q3U0M1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc9Q3U0M1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc9Q3U0M1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc9Q3U0M1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc9Q3U0M1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc9Q3U0M1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc9Q3U0M1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc9Q3U0M1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc9Q3U0M1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc9Q3U0M1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc9Q3U0M1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc9Q3U0M1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc9Q3U0M1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc9Q3U0M1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc9Q3U0M1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc9Q3U0M1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc9Q3U0M1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc9Q3U0M1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc9Q3U0M1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc9Q3U0M1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc9Q3U0M1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc9Q3U0M1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc9Q3U0M1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc9Q3U0M1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc9Q3U0M1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc9Q3U0M1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc9Q3U0M1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc9Q3U0M1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc9Q3U0M1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc9Q3U0M1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc9Q3U0M1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc9Q3U0M1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc9Q3U0M1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc9Q3U0M1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc9Q3U0M1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc9Q3U0M1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc9Q3U0M1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc9Q3U0M1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc9Q3U0M1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc9Q3U0M1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc9Q3U0M1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc9Q3U0M1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc9Q3U0M1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc9Q3U0M1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc9Q3U0M1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc9Q3U0M1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc9Q3U0M1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc9Q3U0M1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc9Q3U0M1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc9Q3U0M1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms