Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdkl4Q3TZA2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdkl4Q3TZA2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdkl4Q3TZA2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdkl4Q3TZA2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdkl4Q3TZA2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdkl4Q3TZA2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdkl4Q3TZA2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdkl4Q3TZA2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdkl4Q3TZA2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdkl4Q3TZA2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdkl4Q3TZA2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdkl4Q3TZA2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdkl4Q3TZA2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdkl4Q3TZA2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdkl4Q3TZA2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdkl4Q3TZA2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdkl4Q3TZA2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdkl4Q3TZA2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdkl4Q3TZA2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkl4Q3TZA2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkl4Q3TZA2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkl4Q3TZA2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkl4Q3TZA2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkl4Q3TZA2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkl4Q3TZA2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkl4Q3TZA2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkl4Q3TZA2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkl4Q3TZA2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdkl4Q3TZA2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdkl4Q3TZA2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdkl4Q3TZA2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdkl4Q3TZA2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkl4Q3TZA2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkl4Q3TZA2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkl4Q3TZA2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkl4Q3TZA2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkl4Q3TZA2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkl4Q3TZA2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkl4Q3TZA2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkl4Q3TZA2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkl4Q3TZA2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdkl4Q3TZA2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdkl4Q3TZA2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdkl4Q3TZA2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdkl4Q3TZA2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdkl4Q3TZA2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdkl4Q3TZA2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdkl4Q3TZA2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdkl4Q3TZA2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdkl4Q3TZA2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms