Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gdpd4Q3TT99 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gdpd4Q3TT99 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gdpd4Q3TT99 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gdpd4Q3TT99 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gdpd4Q3TT99 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gdpd4Q3TT99 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gdpd4Q3TT99 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gdpd4Q3TT99 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gdpd4Q3TT99 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gdpd4Q3TT99 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gdpd4Q3TT99 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gdpd4Q3TT99 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gdpd4Q3TT99 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gdpd4Q3TT99 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gdpd4Q3TT99 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gdpd4Q3TT99 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gdpd4Q3TT99 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdpd4Q3TT99 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdpd4Q3TT99 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdpd4Q3TT99 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdpd4Q3TT99 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdpd4Q3TT99 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdpd4Q3TT99 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gdpd4Q3TT99 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gdpd4Q3TT99 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gdpd4Q3TT99 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gdpd4Q3TT99 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdpd4Q3TT99 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdpd4Q3TT99 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdpd4Q3TT99 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdpd4Q3TT99 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdpd4Q3TT99 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdpd4Q3TT99 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdpd4Q3TT99 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdpd4Q3TT99 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdpd4Q3TT99 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gdpd4Q3TT99 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gdpd4Q3TT99 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gdpd4Q3TT99 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gdpd4Q3TT99 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gdpd4Q3TT99 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gdpd4Q3TT99 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gdpd4Q3TT99 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gdpd4Q3TT99 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gdpd4Q3TT99 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gdpd4Q3TT99 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gdpd4Q3TT99 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gdpd4Q3TT99 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gdpd4Q3TT99 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gdpd4Q3TT99 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gdpd4Q3TT99 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gdpd4Q3TT99 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gdpd4Q3TT99 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gdpd4Q3TT99 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gdpd4Q3TT99 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdpd4Q3TT99 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdpd4Q3TT99 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdpd4Q3TT99 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdpd4Q3TT99 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdpd4Q3TT99 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdpd4Q3TT99 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdpd4Q3TT99 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdpd4Q3TT99 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdpd4Q3TT99 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdpd4Q3TT99 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdpd4Q3TT99 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdpd4Q3TT99 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdpd4Q3TT99 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdpd4Q3TT99 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdpd4Q3TT99 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gdpd4Q3TT99 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gdpd4Q3TT99 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gdpd4Q3TT99 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gdpd4Q3TT99 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gdpd4Q3TT99 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gdpd4Q3TT99 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gdpd4Q3TT99 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gdpd4Q3TT99 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gdpd4Q3TT99 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gdpd4Q3TT99 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gdpd4Q3TT99 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gdpd4Q3TT99 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gdpd4Q3TT99 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gdpd4Q3TT99 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gdpd4Q3TT99 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gdpd4Q3TT99 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gdpd4Q3TT99 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gdpd4Q3TT99 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gdpd4Q3TT99 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gdpd4Q3TT99 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gdpd4Q3TT99 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gdpd4Q3TT99 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gdpd4Q3TT99 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gdpd4Q3TT99 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gdpd4Q3TT99 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gdpd4Q3TT99 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gdpd4Q3TT99 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gdpd4Q3TT99 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gdpd4Q3TT99 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms