Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fubp3Q3TIX6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fubp3Q3TIX6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fubp3Q3TIX6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fubp3Q3TIX6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fubp3Q3TIX6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fubp3Q3TIX6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fubp3Q3TIX6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fubp3Q3TIX6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fubp3Q3TIX6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Fubp3Q3TIX6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fubp3Q3TIX6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fubp3Q3TIX6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fubp3Q3TIX6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fubp3Q3TIX6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Fubp3Q3TIX6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Fubp3Q3TIX6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fubp3Q3TIX6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fubp3Q3TIX6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fubp3Q3TIX6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fubp3Q3TIX6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fubp3Q3TIX6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fubp3Q3TIX6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fubp3Q3TIX6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fubp3Q3TIX6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fubp3Q3TIX6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fubp3Q3TIX6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fubp3Q3TIX6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fubp3Q3TIX6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Fubp3Q3TIX6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fubp3Q3TIX6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fubp3Q3TIX6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fubp3Q3TIX6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fubp3Q3TIX6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fubp3Q3TIX6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fubp3Q3TIX6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fubp3Q3TIX6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fubp3Q3TIX6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fubp3Q3TIX6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fubp3Q3TIX6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fubp3Q3TIX6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fubp3Q3TIX6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fubp3Q3TIX6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fubp3Q3TIX6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fubp3Q3TIX6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fubp3Q3TIX6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fubp3Q3TIX6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fubp3Q3TIX6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fubp3Q3TIX6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fubp3Q3TIX6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fubp3Q3TIX6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fubp3Q3TIX6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fubp3Q3TIX6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fubp3Q3TIX6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fubp3Q3TIX6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fubp3Q3TIX6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fubp3Q3TIX6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fubp3Q3TIX6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fubp3Q3TIX6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fubp3Q3TIX6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fubp3Q3TIX6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fubp3Q3TIX6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fubp3Q3TIX6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fubp3Q3TIX6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fubp3Q3TIX6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fubp3Q3TIX6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms