Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam107bQ3TGF2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam107bQ3TGF2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam107bQ3TGF2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam107bQ3TGF2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam107bQ3TGF2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam107bQ3TGF2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam107bQ3TGF2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam107bQ3TGF2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam107bQ3TGF2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam107bQ3TGF2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam107bQ3TGF2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam107bQ3TGF2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam107bQ3TGF2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Fam107bQ3TGF2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam107bQ3TGF2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam107bQ3TGF2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam107bQ3TGF2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam107bQ3TGF2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam107bQ3TGF2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam107bQ3TGF2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam107bQ3TGF2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam107bQ3TGF2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam107bQ3TGF2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam107bQ3TGF2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam107bQ3TGF2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam107bQ3TGF2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam107bQ3TGF2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam107bQ3TGF2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam107bQ3TGF2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam107bQ3TGF2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam107bQ3TGF2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam107bQ3TGF2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms