Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYF9

KRTAP19-7, Keratin-associated protein 19-7, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP19-7Q3SYF9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
KRTAP19-7Q3SYF9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 694 ms