Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY00

TSGA10IP, Testis-specific protein 10-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSGA10IPQ3SY00 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TSGA10IPQ3SY00 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TSGA10IPQ3SY00 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TSGA10IPQ3SY00 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TSGA10IPQ3SY00 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TSGA10IPQ3SY00 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TSGA10IPQ3SY00 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TSGA10IPQ3SY00 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TSGA10IPQ3SY00 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TSGA10IPQ3SY00 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TSGA10IPQ3SY00 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TSGA10IPQ3SY00 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TSGA10IPQ3SY00 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TSGA10IPQ3SY00 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TSGA10IPQ3SY00 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TSGA10IPQ3SY00 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TSGA10IPQ3SY00 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TSGA10IPQ3SY00 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TSGA10IPQ3SY00 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TSGA10IPQ3SY00 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TSGA10IPQ3SY00 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TSGA10IPQ3SY00 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TSGA10IPQ3SY00 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TSGA10IPQ3SY00 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TSGA10IPQ3SY00 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TSGA10IPQ3SY00 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TSGA10IPQ3SY00 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TSGA10IPQ3SY00 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TSGA10IPQ3SY00 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TSGA10IPQ3SY00 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TSGA10IPQ3SY00 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TSGA10IPQ3SY00 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TSGA10IPQ3SY00 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TSGA10IPQ3SY00 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TSGA10IPQ3SY00 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TSGA10IPQ3SY00 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TSGA10IPQ3SY00 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TSGA10IPQ3SY00 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TSGA10IPQ3SY00 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TSGA10IPQ3SY00 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TSGA10IPQ3SY00 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TSGA10IPQ3SY00 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TSGA10IPQ3SY00 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TSGA10IPQ3SY00 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TSGA10IPQ3SY00 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TSGA10IPQ3SY00 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TSGA10IPQ3SY00 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TSGA10IPQ3SY00 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TSGA10IPQ3SY00 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TSGA10IPQ3SY00 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TSGA10IPQ3SY00 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TSGA10IPQ3SY00 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TSGA10IPQ3SY00 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TSGA10IPQ3SY00 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TSGA10IPQ3SY00 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TSGA10IPQ3SY00 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TSGA10IPQ3SY00 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TSGA10IPQ3SY00 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TSGA10IPQ3SY00 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TSGA10IPQ3SY00 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TSGA10IPQ3SY00 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TSGA10IPQ3SY00 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TSGA10IPQ3SY00 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TSGA10IPQ3SY00 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TSGA10IPQ3SY00 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TSGA10IPQ3SY00 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TSGA10IPQ3SY00 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms