Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zbtb38Q3LR78 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zbtb38Q3LR78 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zbtb38Q3LR78 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zbtb38Q3LR78 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Zbtb38Q3LR78 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Zbtb38Q3LR78 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Zbtb38Q3LR78 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Zbtb38Q3LR78 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Zbtb38Q3LR78 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Zbtb38Q3LR78 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Zbtb38Q3LR78 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Zbtb38Q3LR78 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zbtb38Q3LR78 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Zbtb38Q3LR78 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Zbtb38Q3LR78 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Zbtb38Q3LR78 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Zbtb38Q3LR78 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Zbtb38Q3LR78 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Zbtb38Q3LR78 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zbtb38Q3LR78 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Zbtb38Q3LR78 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zbtb38Q3LR78 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zbtb38Q3LR78 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Zbtb38Q3LR78 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Zbtb38Q3LR78 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Zbtb38Q3LR78 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Zbtb38Q3LR78 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Zbtb38Q3LR78 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Zbtb38Q3LR78 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Zbtb38Q3LR78 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zbtb38Q3LR78 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zbtb38Q3LR78 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zbtb38Q3LR78 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Zbtb38Q3LR78 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zbtb38Q3LR78 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zbtb38Q3LR78 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zbtb38Q3LR78 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zbtb38Q3LR78 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zbtb38Q3LR78 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zbtb38Q3LR78 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Zbtb38Q3LR78 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zbtb38Q3LR78 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zbtb38Q3LR78 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zbtb38Q3LR78 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zbtb38Q3LR78 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zbtb38Q3LR78 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zbtb38Q3LR78 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zbtb38Q3LR78 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Zbtb38Q3LR78 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zbtb38Q3LR78 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zbtb38Q3LR78 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zbtb38Q3LR78 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zbtb38Q3LR78 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zbtb38Q3LR78 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zbtb38Q3LR78 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zbtb38Q3LR78 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zbtb38Q3LR78 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Zbtb38Q3LR78 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zbtb38Q3LR78 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zbtb38Q3LR78 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Zbtb38Q3LR78 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Zbtb38Q3LR78 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Zbtb38Q3LR78 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Zbtb38Q3LR78 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Zbtb38Q3LR78 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Zbtb38Q3LR78 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zbtb38Q3LR78 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zbtb38Q3LR78 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zbtb38Q3LR78 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Zbtb38Q3LR78 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Zbtb38Q3LR78 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Zbtb38Q3LR78 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zbtb38Q3LR78 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zbtb38Q3LR78 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zbtb38Q3LR78 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zbtb38Q3LR78 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zbtb38Q3LR78 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zbtb38Q3LR78 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Zbtb38Q3LR78 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Zbtb38Q3LR78 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Zbtb38Q3LR78 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Zbtb38Q3LR78 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Zbtb38Q3LR78 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Zbtb38Q3LR78 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Zbtb38Q3LR78 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Zbtb38Q3LR78 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Zbtb38Q3LR78 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Zbtb38Q3LR78 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Zbtb38Q3LR78 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zbtb38Q3LR78 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zbtb38Q3LR78 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zbtb38Q3LR78 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zbtb38Q3LR78 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zbtb38Q3LR78 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Zbtb38Q3LR78 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Zbtb38Q3LR78 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Zbtb38Q3LR78 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zbtb38Q3LR78 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zbtb38Q3LR78 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms