Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
KRTAP21-1Q3LI58 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms