Protein–RNA interactions for Protein: Q3E827

LSO1, Protein LSO1, yeastyeast

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSO1Q3E827 ERG29YMR134W 714 nt7.59□□□□□ -1.19
LSO1Q3E827 SNN1YNL086W 309 nt7.59□□□□□ -1.19
LSO1Q3E827 YPT11YNL304W 1254 nt7.59□□□□□ -1.19
LSO1Q3E827 RGT2YDL138W 2292 nt7.59□□□□□ -1.19
LSO1Q3E827 YDR514CYDR514C 1452 nt7.58□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.58□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 ARI1YGL157W 1044 nt7.58□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 SSU72YNL222W 621 nt7.58□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 SSC1YJR045C 1965 nt7.58□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 GAS1YMR307W 1680 nt7.57□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 SGE1YPR198W 1632 nt7.57□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 RTT103YDR289C 1230 nt7.57□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 YER137CYER137C 447 nt7.57□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 MRPL6YHR147C 645 nt7.57□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 YMR007WYMR007W 381 nt7.57□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 RCE1YMR274C 948 nt7.57□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 YNL226WYNL226W 411 nt7.57□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 YPL136WYPL136W 369 nt7.57□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 SUT2YPR009W 807 nt7.57□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 UBA3YPR066W 900 nt7.57□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 NUR1YDL089W 1455 nt7.56□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 NAM8YHR086W 1572 nt7.56□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 YNL247WYNL247W 2304 nt7.55□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 YCR016WYCR016W 873 nt7.55□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 YFT2YDR319C 825 nt7.55□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 YFR020WYFR020W 699 nt7.55□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 YNG2YHR090C 849 nt7.55□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 DCG1YIR030C 735 nt7.55□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 YUR1YJL139C 1287 nt7.55□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 ECM9YKR004C 1134 nt7.55□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 YLL047WYLL047W 384 nt7.55□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 REX2YLR059C 810 nt7.55□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 FAR3YMR052W 615 nt7.55□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 FSH2YMR222C 672 nt7.55□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 YOL035CYOL035C 303 nt7.55□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 ATP4YPL078C 735 nt7.55□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 YFL052WYFL052W 1398 nt7.55□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 ASN2YGR124W 1719 nt7.55□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 MDM10YAL010C 1482 nt7.55□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 HFI1YPL254W 1467 nt7.55□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 ERG12YMR208W 1332 nt7.54□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 TMS1YDR105C 1422 nt7.54□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 ERG26YGL001C 1050 nt7.54□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 MPM1YJL066C 759 nt7.54□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 PSR1YLL010C 1284 nt7.54□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 PTC4YBR125C 1182 nt7.54□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 TUB4YLR212C 1422 nt7.53□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 SHR3YDL212W 633 nt7.53□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 PEX7YDR142C 1128 nt7.53□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 SCL1YGL011C 759 nt7.53□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 ERV14YGL054C 417 nt7.53□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 HIS3YOR202W 663 nt7.53□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 YSA1YBR111C 696 nt7.53□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 VHS1YDR247W 1386 nt7.53□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 PTC6YCR079W 1329 nt7.52□□□□□ -1.2
LSO1Q3E827 RRT6YGL146C 936 nt7.52□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 RDL1YOR285W 420 nt7.52□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 HAT1YPL001W 1125 nt7.52□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 SUI3YPL237W 858 nt7.52□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 Q0017Q0017 162 nt7.52□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 ECM30YLR436C 3825 nt7.52□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 RRP14YKL082C 1305 nt7.52□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.51□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 SPO16YHR153C 597 nt7.51□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 KRE1YNL322C 942 nt7.51□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 TFB6YOR352W 1032 nt7.51□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 HVG1YER039C 750 nt7.5□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 YIR035CYIR035C 765 nt7.5□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 HYM1YKL189W 1200 nt7.5□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 YNL134CYNL134C 1131 nt7.5□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 OMS1YDR316W 1416 nt7.5□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 PDC6YGR087C 1692 nt7.5□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 YOS9YDR057W 1629 nt7.49□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 YDL026WYDL026W 312 nt7.49□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 snR86snR86 1004 nt7.49□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 NIF3YGL221C 867 nt7.49□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 ESS1YJR017C 513 nt7.49□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 YML090WYML090W 387 nt7.49□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt7.49□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 YOL166CYOL166C 339 nt7.49□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 WSC4YHL028W 1818 nt7.48□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 LYS20YDL182W 1287 nt7.48□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 ARO3YDR035W 1113 nt7.48□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 SKI8YGL213C 1194 nt7.48□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 ARD1YHR013C 717 nt7.48□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 PSY3YLR376C 729 nt7.48□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 GTR1YML121W 933 nt7.48□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 CKS1YBR135W 453 nt7.48□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 HMLALPHA1YCL066W 528 nt7.47□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 MATALPHA1YCR040W 528 nt7.47□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 ADK2YER170W 678 nt7.47□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 YJL009WYJL009W 327 nt7.47□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 RSM7YJR113C 744 nt7.47□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 YKL169CYKL169C 384 nt7.47□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 RPF2YKR081C 1035 nt7.47□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 SPE2YOL052C 1191 nt7.47□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 LEA1YPL213W 717 nt7.47□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 VPS72YDR485C 2388 nt7.46□□□□□ -1.21
LSO1Q3E827 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt7.46□□□□□ -1.22
LSO1Q3E827 NSE3YDR288W 912 nt7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 141.8 ms