Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRFIP1Q32MZ4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRFIP1Q32MZ4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRFIP1Q32MZ4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRFIP1Q32MZ4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRFIP1Q32MZ4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRFIP1Q32MZ4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRFIP1Q32MZ4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRFIP1Q32MZ4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRFIP1Q32MZ4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRFIP1Q32MZ4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRFIP1Q32MZ4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRFIP1Q32MZ4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRFIP1Q32MZ4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRFIP1Q32MZ4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRFIP1Q32MZ4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRFIP1Q32MZ4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRFIP1Q32MZ4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRFIP1Q32MZ4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRFIP1Q32MZ4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRFIP1Q32MZ4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRFIP1Q32MZ4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRFIP1Q32MZ4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRFIP1Q32MZ4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRFIP1Q32MZ4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRFIP1Q32MZ4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRFIP1Q32MZ4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRFIP1Q32MZ4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRFIP1Q32MZ4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRFIP1Q32MZ4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRFIP1Q32MZ4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRFIP1Q32MZ4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRFIP1Q32MZ4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRFIP1Q32MZ4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRFIP1Q32MZ4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRFIP1Q32MZ4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRFIP1Q32MZ4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRFIP1Q32MZ4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRFIP1Q32MZ4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRFIP1Q32MZ4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRFIP1Q32MZ4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRFIP1Q32MZ4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRFIP1Q32MZ4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRFIP1Q32MZ4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRFIP1Q32MZ4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
LRRFIP1Q32MZ4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRFIP1Q32MZ4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRFIP1Q32MZ4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRFIP1Q32MZ4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRFIP1Q32MZ4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRFIP1Q32MZ4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRFIP1Q32MZ4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRFIP1Q32MZ4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRFIP1Q32MZ4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRFIP1Q32MZ4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRFIP1Q32MZ4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRFIP1Q32MZ4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRFIP1Q32MZ4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRFIP1Q32MZ4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRFIP1Q32MZ4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRFIP1Q32MZ4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRFIP1Q32MZ4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRFIP1Q32MZ4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms