Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL98

VMAC, Vimentin-type intermediate filament-associated coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMACQ2NL98 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VMACQ2NL98 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VMACQ2NL98 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VMACQ2NL98 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VMACQ2NL98 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VMACQ2NL98 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VMACQ2NL98 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VMACQ2NL98 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VMACQ2NL98 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VMACQ2NL98 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VMACQ2NL98 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VMACQ2NL98 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VMACQ2NL98 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VMACQ2NL98 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VMACQ2NL98 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VMACQ2NL98 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VMACQ2NL98 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VMACQ2NL98 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VMACQ2NL98 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VMACQ2NL98 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VMACQ2NL98 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VMACQ2NL98 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VMACQ2NL98 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VMACQ2NL98 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VMACQ2NL98 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VMACQ2NL98 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VMACQ2NL98 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VMACQ2NL98 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VMACQ2NL98 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VMACQ2NL98 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VMACQ2NL98 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VMACQ2NL98 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms