Protein–RNA interactions for Protein: Q2I0M5

RSPO4, R-spondin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO4Q2I0M5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RSPO4Q2I0M5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RSPO4Q2I0M5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RSPO4Q2I0M5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RSPO4Q2I0M5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RSPO4Q2I0M5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RSPO4Q2I0M5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RSPO4Q2I0M5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RSPO4Q2I0M5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RSPO4Q2I0M5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RSPO4Q2I0M5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RSPO4Q2I0M5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RSPO4Q2I0M5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPO4Q2I0M5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPO4Q2I0M5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPO4Q2I0M5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPO4Q2I0M5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPO4Q2I0M5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPO4Q2I0M5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPO4Q2I0M5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPO4Q2I0M5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPO4Q2I0M5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPO4Q2I0M5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPO4Q2I0M5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPO4Q2I0M5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPO4Q2I0M5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RSPO4Q2I0M5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RSPO4Q2I0M5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms