Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SWI5Q1ZZU3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SWI5Q1ZZU3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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