Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMA3Q16787 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMA3Q16787 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMA3Q16787 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMA3Q16787 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMA3Q16787 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LAMA3Q16787 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LAMA3Q16787 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LAMA3Q16787 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMA3Q16787 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMA3Q16787 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMA3Q16787 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMA3Q16787 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMA3Q16787 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMA3Q16787 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMA3Q16787 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMA3Q16787 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMA3Q16787 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMA3Q16787 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMA3Q16787 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMA3Q16787 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMA3Q16787 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMA3Q16787 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMA3Q16787 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMA3Q16787 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAMA3Q16787 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAMA3Q16787 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LAMA3Q16787 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LAMA3Q16787 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAMA3Q16787 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAMA3Q16787 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LAMA3Q16787 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LAMA3Q16787 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LAMA3Q16787 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMA3Q16787 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMA3Q16787 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMA3Q16787 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMA3Q16787 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LAMA3Q16787 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMA3Q16787 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMA3Q16787 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMA3Q16787 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMA3Q16787 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMA3Q16787 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMA3Q16787 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMA3Q16787 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMA3Q16787 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMA3Q16787 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMA3Q16787 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMA3Q16787 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMA3Q16787 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMA3Q16787 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMA3Q16787 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMA3Q16787 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMA3Q16787 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMA3Q16787 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
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