Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRA6Q16445 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA6Q16445 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRA6Q16445 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms