Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX2Q16385 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX2Q16385 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX2Q16385 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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