Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1EQ15878 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1EQ15878 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1EQ15878 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1EQ15878 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1EQ15878 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1EQ15878 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1EQ15878 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1EQ15878 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1EQ15878 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1EQ15878 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1EQ15878 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1EQ15878 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1EQ15878 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1EQ15878 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1EQ15878 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1EQ15878 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1EQ15878 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1EQ15878 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1EQ15878 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1EQ15878 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1EQ15878 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1EQ15878 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1EQ15878 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1EQ15878 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1EQ15878 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1EQ15878 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1EQ15878 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1EQ15878 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1EQ15878 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1EQ15878 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms