Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD8Q15843 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD8Q15843 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD8Q15843 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD8Q15843 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD8Q15843 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD8Q15843 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD8Q15843 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD8Q15843 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD8Q15843 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD8Q15843 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD8Q15843 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD8Q15843 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD8Q15843 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD8Q15843 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD8Q15843 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD8Q15843 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD8Q15843 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD8Q15843 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD8Q15843 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD8Q15843 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD8Q15843 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD8Q15843 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD8Q15843 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD8Q15843 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD8Q15843 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD8Q15843 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD8Q15843 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD8Q15843 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD8Q15843 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD8Q15843 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD8Q15843 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD8Q15843 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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