Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
NCOA1Q15788 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NCOA1Q15788 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NCOA1Q15788 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NCOA1Q15788 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NCOA1Q15788 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
NCOA1Q15788 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
NCOA1Q15788 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
NCOA1Q15788 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
NCOA1Q15788 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NCOA1Q15788 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
NCOA1Q15788 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NCOA1Q15788 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NCOA1Q15788 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NCOA1Q15788 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
NCOA1Q15788 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NCOA1Q15788 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NCOA1Q15788 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
NCOA1Q15788 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NCOA1Q15788 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
NCOA1Q15788 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NCOA1Q15788 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
NCOA1Q15788 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NCOA1Q15788 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
NCOA1Q15788 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
NCOA1Q15788 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NCOA1Q15788 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NCOA1Q15788 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
NCOA1Q15788 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NCOA1Q15788 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NCOA1Q15788 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
NCOA1Q15788 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
NCOA1Q15788 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NCOA1Q15788 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
NCOA1Q15788 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NCOA1Q15788 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NCOA1Q15788 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
NCOA1Q15788 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NCOA1Q15788 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NCOA1Q15788 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NCOA1Q15788 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NCOA1Q15788 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NCOA1Q15788 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NCOA1Q15788 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NCOA1Q15788 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NCOA1Q15788 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
NCOA1Q15788 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NCOA1Q15788 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
NCOA1Q15788 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NCOA1Q15788 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
NCOA1Q15788 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NCOA1Q15788 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
NCOA1Q15788 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NCOA1Q15788 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NCOA1Q15788 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
NCOA1Q15788 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
NCOA1Q15788 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
NCOA1Q15788 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
NCOA1Q15788 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
NCOA1Q15788 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
NCOA1Q15788 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
NCOA1Q15788 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
NCOA1Q15788 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
NCOA1Q15788 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
NCOA1Q15788 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NCOA1Q15788 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NCOA1Q15788 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
NCOA1Q15788 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NCOA1Q15788 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
NCOA1Q15788 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
NCOA1Q15788 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NCOA1Q15788 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
NCOA1Q15788 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
NCOA1Q15788 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
NCOA1Q15788 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NCOA1Q15788 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NCOA1Q15788 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
NCOA1Q15788 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NCOA1Q15788 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
NCOA1Q15788 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NCOA1Q15788 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NCOA1Q15788 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NCOA1Q15788 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NCOA1Q15788 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NCOA1Q15788 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
NCOA1Q15788 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NCOA1Q15788 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
NCOA1Q15788 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NCOA1Q15788 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NCOA1Q15788 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NCOA1Q15788 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
NCOA1Q15788 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NCOA1Q15788 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NCOA1Q15788 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
NCOA1Q15788 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NCOA1Q15788 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NCOA1Q15788 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NCOA1Q15788 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NCOA1Q15788 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NCOA1Q15788 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
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