Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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TWIST1Q15672 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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TWIST1Q15672 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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TWIST1Q15672 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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TWIST1Q15672 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
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TWIST1Q15672 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TWIST1Q15672 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
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