Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAM1Q15629 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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